城市:马特·麦考密克(Matt McCormick),尼尔斯(Niels
我们非常高兴地宣布释放ITKElastix 0.16.0,这是一个ITK模块,它为elastix提供了Python和C ++接口,这是一种用于刚性和非固定图像的工具箱。 ððº游戏ð§ð
注册是找到空间转换的任务,该空间转换通过优化相关图像相似性指标来使一个图像与另一个图像对齐。
有关如何注册科学图像的更多信息,请参见itk-elastix jupyter notebooks和elastix manual。
monai深度学习注册,使用Elastix预先对准(jupyter notebook)。
ð¾下载
安装二进制python软件包:
pip install itk-elastix
- 亮点
itkelastix 0.16.0与elastix 5.1.0一起发布。添加的功能包括:
- ð跨平台二进制python包现在为80%
- ðMacOS,Linux Arm Python软件包
- ð£!更新了MONAI deep learning registration with affine pre-alignment using itk-elastix上的示例笔记本
- ð度量计算的重大绩效改进;在某些情况下加速注册40%或以上
- C ++ 14现代化
- 升级为ITK 5.3.0
- 支持ITK转换类型:翻译,仿射,Euler(2D和3D),相似性(2D和3D)和BSPLINE
- add getCombinationTransForm(), getNumberofTransForms(), getnthtranstorm(n), converttottoktransform(transform) to
itk::ElastixRegistrationMethod
- add setCombinationTransForm(转换) to
itk::TransformixFilter
,用于通过库接口访问和使用转换对象
有关更多详细信息,请参见完整的elastix 5.1.0 release notes和ITKElastix 0.16.0 release notes。
ð£!接下来是什么
在下一个版本中,我们将发布有关如何支持Project MONAI的医学图像深度学习人工智能(AI)的其他笔记本。这些改进是与Monai社区合作进行的,因为itk
Python软件包的空间元数据在monai
硬化并扩展了Monai的医疗图像注册功能。我们将在napari集成中更新当前的elastix_napari。此外,WebAssembly构建将通过itk-wasm创建。
ð致谢
itkelastix的一部分是由以下支持的支持:
- NIH NIMH BRAIN Initiative奖励1RF1MH126732。
- Chan Zuckerberg Initiative(CZI)Open Source Image Registration: The elastix Toolbox的基本开源科学奖。
享受ITK和Elastix!